بی شک، ترتیب آیات قرآن در قالب سورهها و به شکل موجود، همان ترتیبی است که در زمان رسول خدا صلیاللهعلیهوآلهوسلّم و به دستور آن حضرت، رایج بوده است؛ به عبارت دیگر، امری توقیفی است که هیچ گونه اجتهادی در آن راه ندارد؛ اما ترتیب رایج سورهها به اعتقاد بیشتر پژوهشگران علوم قرآن ناشی از رای و اجتهاد صحابه است. در مقابل، گروهی دیگر از محققان معتقدند ترتیب سورههای قرآن نیز به دستور رسول خدا صلیاللهعلیهوآلهوسلّم بوده و امری توقیفی است.