در منطقه قبا مکان‌های مختلفی وجود داشت که پیوسته مورد توجه زائران بود اما بسیاری از این مساجد به مرور زمان از میان رفته است.
پیش از بازسازی جدید مسجد قبا، دو مسجد کوچک در سمت قبله آن بوده است: نخست خانه کلثوم بن هِدْم و دوّم خانه سعدبنخیثمه که هر دو در بازسازی جدید، تخریب و جزو مسجد شده‌است.
